组蛋白八聚体由组蛋白H2A、H2B、H3和H4的各两个亚基组成,由DNA包裹形成核小体。组蛋白亚基的N末端含有可进行翻译后修饰的残基。H3上的赖氨酸残基K4可以单、二或三甲基化,分别形成H3K4me1、H3K4me2或H3K4me3。H3K4me1、H3K4me2和H3K4me3位于整个基因组的不同区域。H3K4me1修饰主要分布在活性增强子元件中;H3K4me2修饰主要分布在转录活跃基因的gene body区;而H3K4me3修饰主要分布在TSS附近的启动子区并激活转录。
图片来源: PMID: 30616667
关于H3K4me1
H3K4me1是组蛋白H3蛋白的第4个赖氨酸残基处的单甲基化,通常与基因增强子相关。H3K4me1富集在活性和primed增强子区域内。增强子由组蛋白H3K4单/二甲基转移酶MLL4引发,然后由组蛋白H3K27乙酰转移酶p300激活。H3K4me1会微调增强子的活性和功能,而不是控制。具有MLL3/4的H3K4me1也可以作用于启动子并抑制基因。H3K4me1修饰是真核细胞增强子的表观遗传学标记,可用于增强子在基因组上定位。 | |
EpiCypher H3K4me1抗体
EpiCypher在CUT&RUN和CUT&Tag实验中筛选了数百种抗体,并通过独有的SNAP-Certification技术进行验证,为研究者提供了可识别经过修饰的组蛋白和相关细胞靶点的组蛋白PTM抗体。H3K4me1抗体是EpiCypher最新推出的SNAP-Certified™抗体之一,符合CUT&RUN和CUT&Tag应用中特异性和有效靶标富集的标准。
产品详情
产品货号 | 13-0057 |
产品名称 | H3K4me1 Antibody, SNAP-Certified™ for CUT&RUN and CUT&Tag |
规格 | 100 µg |
产品类型 | Monoclonal [2088-1F4] |
宿主 | Rabbit |
浓度 | 0.5 mg/mL |
反应种属 | Human, Wide Range(Predicted) |
实验应用 | CUT&RUN, CUT&Tag |
免疫原 | A synthetic peptide corresponding to histone H3 monomethylated at lysine 4 |
保存温度 | Stable for 1 year at 4°C from date of receipt |
配方 | Antigen affinity-purified antibody in Borate buffered saline pH 8.0, 0.09% sodium azide |
建议稀释度 | 0.5 µg per reaction for CUT&RUN and CUT&Tag |
实例分析
图1. CUT&RUN中SNAP特异性分析
图2. CUT&Tag中SNAP特异性分析
使用SNAP-CUTANA™ K-MetStat Panel对H3K4me1抗体进行分析,其与相关组蛋白PTMs的交叉反应性<20%。
图3. CUT&RUN和CUT&Tag全基因组富集
H3K4me1抗体和H3K4me3阳性对照产生预期的富集效果,不同数量细胞核的结果保持一致。
500k和50k K562细胞CUT&RUN 峰图
图4. H3K4me1抗体CUT&RUN和CUT&Tag峰图
H3K4me1抗体在CUT&RUN和CUT&Tag应用中符合EpiCypher特定批次SNAP-Certified™标准,并且不同的细胞数量下,一致的基因组富集证实了高靶向效率。
关于EpiCypher
EpiCypher是一家成立于2012年的表观遗传学公司。从专有组蛋白肽阵列平台EpiGold™开始,EpiCypher开发了一系列同类产品。同时,EpiCypher是重组核小体制造和开发的全球领导者。利用其独有技术,不断添加高纯度修饰重组核小体(dNucs™)产品。dNuc™多样性的产品为破译组蛋白编码和加速药物开发提供了强大的工具。
EpiCypher还将dNuc™技术广泛的应用于多种分析测定产品中,包括:SNAP-ChIP®Spike-in Controls(用于抗体分析和ChIP定量), EpiDyne®底物(用于染色质重塑和抑制剂筛选及开发),dCyher™测定(用于探究表观遗传蛋白质-组蛋白PTM结合相互作用)。最近,EpiCypher还推出了针对ChIC、CUT&RUN和CUT&Tag的高灵敏度表观基因组图谱CUTANA™分析。
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